自离后发的工资被扣两千多怎么办？

处理方式如下：
1. 协商：直接与用人单位沟通，尝试解决工资被扣问题。
2. 投诉：若协商无果，向劳动监察大队投诉，依据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》维护权益。
3. 仲裁：投诉后问题仍未解决，可向劳动仲裁委员会申请仲裁，按照申请、受理、开庭、调解、裁决的流程进行。
4. 起诉：对仲裁结果不满，可在规定时间内向法院起诉，通过法律途径维护自己的合法权益。
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首先，您应尝试与用人单位协商解决工资被扣问题。若协商无果，可根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》向劳动监察大队投诉，劳动行政部门会责令用人单位支付工资。若用人单位仍不支付，您可直接申请劳动仲裁，甚至起诉至法院。不及时处理，可能会影响您的合法权益，导致经济损失及法律纠纷持续。
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常见处理方式包括与用人单位协商、投诉劳动监察大队、申请劳动仲裁以及起诉至法院。建议先尝试协商，协商不成再选择法律途径，如投诉或仲裁，以确保问题得到妥善解决。选择处理方式时，需考虑效率与成本，以及个人时间与精力。